|
|
Nachwort zu Lerneinheit 3:
Umsetzung von Gen- in Proteinsequenzen
 Antwort zu Frage 1
Antwort zu Frage 2
Antwort zu Frage 3
Antwort zu Frage 4
Antwort zu Frage 5
Kommentare
Antwort zu Frage 4
4. Welche der folgenden Sequenzen enthalten ein ORF? (Ein Tip: Suchen Sie vom 5’-Ende aus nach dem ersten Startcodon. Zählen Sie dann jeweils drei Basen ab und achten Sie auf Stopcodons.)
- ____ ...5'-atg cga tca aat att tta agt ctc agg gcg ata ctt gat a-3'...
- ____ ...5'-atcacgta atg ggg tat tat gtt ttg aaa gat agc atc gct-3'...
- __X_ ...5'-cttat atg ttg ata tca cgt aat ggc tga tcg aac ctt ttt-3'...
Anmerkung: Nur die dritte Sequenz enthält ein offenes Leseraster. Bei der computergestützten Suche nach ORFs, die wahrscheinlich Peptide codieren, legt man als Kriterium häufig eine Mindestzahl von Codons zwischen Start- und Stopcodon fest. Da es drei Stopcodons gibt, kommen sie mit einer durchschnittlichen Häufigkeit von 3/64 oder etwa 1 zu 20 vor. Bei einer rein zufälligen Verteilung folgt auf ein ATG-Codon mit hoher Wahrscheinlichkeit innerhalb der nächsten 20 Codons ein Stopcodon, das heißt, der Abschnitt codiert kein Peptid. Die meisten Peptide sind groß (mit 110 oder mehr Aminosäuren); deshalb ist es aus statistischen Gründen unwahrscheinlich, dass auf ein Startcodon mehrere hundert Codons folgen, ohne dass der Abschnitt ein Peptid codiert.
Betrachten Sie noch einmal die Genkarte für Mycoplasma genitalium . Entsprechen die Pfeile, die mit MG001, MG002 usw. bezeichnet sind, den Genen oder den ORFs? ORFs.
|
|
