Das Bakteriengenom





Lerneinheit 1: Kartierung eines Genoms

Übung 2: Rekonstruktion einer DNA-Sequenz
Im Gegensatz zum Alphabet mit seinen 26 Buchstaben gibt es in der DNA nur vier verschiedene Bausteine: Nucleotide mit den Purin- und Pyrimidinbasen A, C, G und T. Die folgende Übung ähnelt Übung 1, nur mit dem Unterschied, dass Sie sich diesmal mit der tatsächlichen Sequenz eines Gens befassen. Dieses Gen ist eines der vielen Tausend, die man bei der Rekonstruktion eines Bakteriengenoms untersucht hat.




Vorbereitung:
Drucken Sie das Lerneinheit 1: Arbeitsblatt:aus. Schneiden Sie die Sequenzbruchstücke für die Übung 2 heraus.


Übung:
Ordnen Sie die Fragmente an. Achten Sie dabei auf überlappende, übereinstimmende Enden. Kleben Sie die Fragmente entsprechend zusammen, und rekonstruieren Sie so die gesamte ursprüngliche Sequenz.

Beantworten Sie folgende Fragen:

  1. Handelt es sich um eine lineare Sequenz mir erkennbarem Anfang und Ende, oder ist sie ringförmig? ______
  2. Aus wievielen Basen besteht das gesamte Gen? ______
  3. Wieviele Aminosäuren sollte das Gen codieren? ______
  4. Denken Sie daran, dass das Gesamtgenom des kleinsten Bakteriums aus 580 000 Basenpaaren besteht; berechnen Sie, wie oft Sie den Vorgang wiederholen müssten, um das gesamte Genom zu erfassen. (Daran werden Sie erkennen, warum es ohne Computer nicht geht!) ______

Anmerkung: Wenn Sie mit dieser Übung fertig sind, möchten Sie Ihre Ergebnisse vielleicht mit der tatsächlichen Sequenz des Gens vergleichen. Gehen Sie zurück zur Einleitung und benutzen Sie den Link unter „Lerneinheit 1“. Diese Datenbank steht allgemein zur Verfügung: Wissenschaftler aus der ganzen Welt können die Daten in unterschiedlicher Form abrufen, um sie für Forschung, Lehre und Lernen zu verwenden.

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