Weitere genetische Vielfalt entsteht in der Meiose durch das sogenannte Crossover zwischen mütterlichen und väterlichen Chromatidpaaren, das sich in der Prophase I abspielt.

Befinden sich in den betroffenen Abschnitten unterschiedliche Allele, handelt es sich bei den Produkten des Crossovers um genetische Rekombinanten dieser Allele.

Der Begriff des Crossover wird in dem Abschnitt über Mendel-Genetik genauer erläutert.