Analyse von DNA-Fragmenten durch Gelelektrophorese
Häufig ist es wichtig, nach der Elektrophorese festzustellen, wie groß die DNA-Fragmente sind.
Dazu kann man ganz einfach neben der DNA aus dem Experiment auch ein Gemisch von Marker-DNA auf dem Gel mitlaufen lassen. Dieses Gemisch enthält mehrere DNA-Fragmente von bekannter Länge. So wird beispielsweise die genomische DNA des Bakteriophagen Lambda von dem Enzym HindIII in acht Fragmente von 23130, 9416, 6557, 4361, 2322, 2027, 564 und 125 Basenpaaren gespalten. (Das Fragment mit 125 Basenpaaren findet man im Experiment häufig nicht wieder, entweder weil es zu schwach aufleuchtet oder weil es aus dem Gel hinausläuft. Im weiteren Verlauf der Lerneinheit wird diese Bande nicht mehr berücksichtigt.) Die Abbildung zeigt als Beispiel ein solches Gel mit Marker-DNA und zwei „unbekannten“ DNA-Proben.
Dazu kann man ganz einfach neben der DNA aus dem Experiment auch ein Gemisch von Marker-DNA auf dem Gel mitlaufen lassen. Dieses Gemisch enthält mehrere DNA-Fragmente von bekannter Länge. So wird beispielsweise die genomische DNA des Bakteriophagen Lambda von dem Enzym HindIII in acht Fragmente von 23130, 9416, 6557, 4361, 2322, 2027, 564 und 125 Basenpaaren gespalten. (Das Fragment mit 125 Basenpaaren findet man im Experiment häufig nicht wieder, entweder weil es zu schwach aufleuchtet oder weil es aus dem Gel hinausläuft. Im weiteren Verlauf der Lerneinheit wird diese Bande nicht mehr berücksichtigt.) Die Abbildung zeigt als Beispiel ein solches Gel mit Marker-DNA und zwei „unbekannten“ DNA-Proben.
