Das Bakteriengenom






Anmerkungen zur Lerneinheit 2:
Abgrenzung von Genkategorien

Antworten auf Frage 1 und 2
Antworten auf Frage 3 und 4
Antworten auf Frage 5 und 6
Antworten auf Frage 7 bis 9
Kommentare

Antworten zu den Fragen 3 und 4
3.

    Sind alle Gene gleich groß? Nein.

    Welches ist das größte und das kleinste Gen, das Sie finden können? Wir haben uns nicht alle einzeln angesehen, Sie können also bessere Antworten als diese finden. Bisher sind die Rekordhalter MMG218 (das größte mit 5414 Basen) und MG174 (das kleinste mit 110 Basen).

    Welche Schwankungen gibt es bei der Größe? Sind die größten Gene doppelt, fünfmal oder hundertmal so groß wie die kleinsten? (Eine ungefähre Antwort reicht aus.) Nach den genannten Beispielen gibt es Schwankungen etwa um den Faktor 50.

    Wenn die Gene sehr unterschiedlich groß sind, könnte unsere anfängliche Berechnung von 580 "durchschnittlichen" Genen ziemlich weit daneben liegen. Wieviele Gene sind es wirklich? Aufgeführt sind 470 nummerierte Gene.

    Wie nahe sind wir mit der ursprünglichen Schätzung von 580 Genen den wirklichen Verhältnissen gekommen? Wir liegen um etwa 20 Prozent falsch.

4. Liegen alle Gene einer bestimmten Kategorie gehäuft zusammen, oder verteilen sie sich über die gesamte DNA? Greifen wir für unsere Analyse einmal ein paar Kategorien heraus.

(a) Gene, die an der Replikation beteiligt sind. (Ein Tip: Diese Gene sind in der Tabelle der Kategorien gelb gekennzeichnet.)

    Liegen sie gehäuft in einem bestimmten Bereich, verteilen sie sich zufällig, oder bilden sie mehrere Ansammlungen? Sie sind mehr oder weniger zufällig verstreut.

    Wenn Ansammlungen vorhanden sind: Wie groß ist die maximale Zahl der Gene einer einzigen Kategorie, die gehäuft zusammen liegen? In mehreren Fällen liegen zwei Gene (die vermutlich ein Operon bilden) nebeneinander, so beispielsweise die Gene 262 und 262 oder die Gene 003 und 004.

(b) Gene, die an der Translation mitwirken.
    Liegen sie gehäuft in einem bestimmten Bereich, verteilen sie sich zufällig, oder bilden sie mehrere Ansammlungen? Sie sind weit verstreut und bilden zahlreiche Ansammlungen.

    Wenn Ansammlungen vorhanden sind: Wie groß ist die maximale Zahl der Gene einer einzigen Kategorie, die gehäuft zusammen liegen? 20 Gene (Nr. 150-169).

    Welche Funktion haben die Gene in dieser Gruppe? (Ein Tip: Klicken Sie auf mehrere Pfeile und sehen Sie sich die Beschreibung der Gene an.) Alle codieren ribosomale Proteine. Angesichts der Tatsache, dass jede Ribosomenuntereinheit von jedem dieser Proteine ein Molekül benötigt, erscheint ein solcher Aufbau durchaus logisch. Andere Gene für ribosomale Proteine, zum Beispiel MG081-083 oder 417-418, liegen weit entfernt.

(c) Gene, die am Energiestoffwechsel mitwirken.

    Gene, die am Energiestoffwechsel mitwirken. Liegen sie gehäuft in einem bestimmten Bereich, verteilen sie sich zufällig, oder bilden sie mehrere Ansammlungen Die meisten liegen gehäuft in bestimmten Bereichen: MG271-271, 400-405, 300-301, 430-431.

    Wenn Ansammlungen vorhanden sind: Wie groß ist die maximale Zahl der Gene einer einzigen Kategorie, die gehäuft zusammen liegen? Die größte ununterbrochene Gruppe ist MG400-405 mit sechs Genen.

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